1873 yılında Hollanda'da doğdu. Hollanda işçi sınıfı hareketinin önde gelen teorisyenlerinden olan Pannekoek, Marksizm'in doğa bilimleri ve felsefe ile ilişkisi konusunda çalışmalar yaptı. Marksizm ve Darwinizm ve Lenin'in Filozofluğu bu çalışmalar içinde en önemlileri arasında sayılır. Lenin'in ünlü Sol Komünizm: Bir Çocukluk Hastalığı kitabının hedeflerinden biri olan Pannekoek, yandaşı "sol" komünistlerle birlikte III. Enternasyonal'den atılarak uluslararası komünist hareket içinde yalnızlığa mahkûm edildi. Anton Pannekoek 1960'ta öldü.